A pesquisa no LEMiMo tem como objetivos identificar surtos bacterianos, detectar mecanismos de resistência antimicrobiana e buscar novos compostos antibacterianos.

Nós temos interesse em estudar as linhagens bacterianas e seus elementos genéticos móveis (EGM) carreando genes de resistência. Entender como se dá a disseminação da resistência aos antibióticos pode ajudar na busca de novos fármacos. LEMiMo participa do Centro de Pesquisa e Inovação em Biodiversidade e Fármacos (CIBFar) em busca de compostos ativos contra bactérias, tanto  Gram-positivas quanto Gram-negativas, nas suas formas planctônicas ou de biofilme.